官方文档、免费课程、数据库、社区和动手环境——把散落在互联网上的好东西集中到一页。
学软件的第一原则：先读官方文档，再看二手教程。
Rosetta 全套文档 + 教程，从安装到高级应用。命令行应用和协议都在这里查。
Python 版 Rosetta 的分步教程，适合理解能量函数、design 和 relax 的每一步。
README 里有安装、示例和 Colab。binder 模式、motif scaffolding 的用法都在这。
README 里的用法示例 + Colab 链接。序列设计入门从这里开始。
各种 Colab 入口（AlphaFold2、复合物、RoseTTAFold），浏览器里直接预测。
ESM 系列模型的安装与示例：ESMFold 预测、embedding、突变打分、ESM3 生成。
课程视频 > 博客文章，因为设计是「看过程」的学科。
华盛顿大学 Baker lab 相关的研究生课程，YouTube 上可找到完整录像，是计算蛋白设计最好的免费课程之一。
1 小时讲完从头设计 20 年，建议看两遍：第一遍听故事，第二遍记术语。
顶级科学家讲解折叠与结构生物学的免费视频，适合补基础。
以分子结构为主题的教育资源：可视化教程、主题科普、PDF 手册，非常友好。
YouTube 上搜 AlphaFold explained，有大量 20–40 分钟的直观讲解，适合建立直觉。
先看通用扩散模型讲解（加噪/去噪直觉），再看 RFdiffusion 论文图，理解成本大幅下降。
设计要「用数据」，不只是「读数据」。
蛋白设计社区非常开放，提问和分享是学习最快的路径。
binder 设计、从头设计、酶设计三个实操课程包，先看看定价和内容边界。
Rosetta/RFdiffusion/ProteinMPNN 的官方问答社区，报错先搜这里。
Baker lab 大本营。官网有最新论文、新闻、开源工具和招聘，值得订阅。
游戏内置教程 + 玩家论坛，新手提问很友好。
蛋白科学学会，年会（含计算设计分会场）和开放资源。
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