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从头设计(de novo)实战(4 周)
目标:跑通「功能位点 → 骨架生成 → 序列设计 → 回测」完整流水线,完成一个全新蛋白折叠的设计项目。
学习闭环
每周按「作业清单」自检 → 完成对应周自测(自动判分)→ 通过后进入下一周。全程不需要发邮件或留言板留言,测试系统会告诉你哪些知识点需要回去复习。
完整课程正文在面包多商品页阅读;网站自测注册会员即可免费做。
前置要求
会打开并运行 Colab(或本地 GPU),能跑通 RFdiffusion 与 ProteinMPNN 的最基本流程(可用「binder 实战」第 1–3 周作为热身,或先完成实践中心的 ColabFold / ProteinMPNN 两个免费任务)。酶设计课程可接着本课程继续。
课程大纲
| 周 | 主题 | 核心产出 | 状态 |
| W1 | 从头设计基础与经典案例拆解 | 流水线思维导图 | ✅ 已上线 |
| W2 | Motif scaffolding 与 RFdiffusion | 第一批 scaffold 骨架 | ✅ 已上线 |
| W3 | 序列设计 + AlphaFold 回测闭环 | 候选序列 + 回测报告 | ✅ 已上线 |
| W4 | 案例复盘与实验衔接 | 完整设计包 | ✅ 已上线 |